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查看详情本文件描述了一种从土壤样品直接提取DNA的方法,这些提取的DNA被用来开展基于各种分子生物学技术[包括实时定量PCR(qPCR)]的土壤细菌群落丰度和组成分析。该方法主要适用于农业及森林土壤。该方法可能不适用于富含有机质的土壤(如泥炭土)、有机污染物或重金属严重污染的土壤。
土壤样品直接提取DNA为研究微生物群落α多样性和β多样性提供了独特视角。通过土壤DNAPCR扩增获得扩增子的下一代测序,将有助于开发土壤环境中微生物群落监测的常规工具。
中国科学院南京土壤研究所、中国科学院亚热带农业生态研究所、江苏省质量和标准化研究院等
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